Biodiversité marine en Méditerranée : espèces à protéger et réglementation

Fiche pratique pour le plaisancier qui navigue entre Marseille, la Corse et la frontière italienne. Ce que la Méditerranée abrite de protégé, ce que la réglementation interdit, et ce que coûte une infraction en 2026. Chiffres vérifiés en avril 2026 à partir des sources officielles listées en fin d'article.

La Méditerranée couvre moins de 1 % de la surface océanique mondiale mais abrite entre 8 et 10 % de la biodiversité marine connue. Côté français : trois parcs nationaux, deux parcs naturels marins, un sanctuaire international, et une pile d'arrêtés préfectoraux qui changent tous les deux ans.

Espèces phares à connaître avant d'aller poser l'ancre

Sept espèces méritent d'être identifiées à vue. Les confondre ou les déranger expose à des sanctions lourdes, et surtout prive la Méditerranée d'espèces qu'on a failli perdre.

La posidonie (Posidonia oceanica). Plante à fleurs endémique de la Méditerranée qu'on confond souvent avec une algue. 80 000 hectares recensés côté français, environ 800 km2, soit 33,5 % des fonds entre 0 et 40 m en PACA et 66,2 % en Corse (Office français de la biodiversité, 2024). Protégée par arrêté ministériel du 19 juillet 1988. WWF estime qu'elle a perdu 34 % de sa surface en Méditerranée en 50 ans. C'est elle qui déclenche la majorité des PV mouillage sur la Côte d'Azur.

La grande nacre (Pinna nobilis). Le plus grand coquillage de Méditerranée, jusqu'à 1 m, planté à la verticale dans l'herbier. Pratiquement disparue depuis 2016 à cause d'un parasite (Haplosporidium pinnae). En voir une vivante relève de l'exception. Strictement protégée, interdiction de la cueillir ou de la déterrer. Si votre ancre croche dedans, même barème que la posidonie.

Le mérou brun (Epinephelus marginatus). Poisson emblème du Parc de Port-Cros, celui qu'on voit s'approcher des plongeurs. Pêche interdite en Méditerranée française depuis l'arrêté du 27 mars 1993, moratoire renouvelé pour dix ans en décembre 2023 par arrêtés DIRM PACA et préfecture de Corse R20/002. Fin du moratoire prévue en décembre 2033. Consultation publique 2023 : 97,57 % d'avis favorables à la reconduction. Chasse sous-marine également interdite. Relâcher un mérou pris au hameçon reste une infraction, puisque le toucher est déjà prohibé.

Le corb (Sciaena umbra). Poisson noir à nageoires bordées d'or, très sédentaire, cible facile au fusil. Sous moratoire depuis 2013, reconduit en décembre 2023 pour dix ans aux mêmes conditions que le mérou. Pêche de loisir et chasse sous-marine totalement interdites jusqu'en 2033.

La tortue caouanne (Caretta caretta). Présente toute l'année, pond rarement sur les plages françaises (quelques cas en Corse et au Lavandou depuis 2020). Si vous croisez une tortue en surface, coupez les gaz et passez à distance : elles respirent, elles sont vulnérables aux hélices. Collision ou tortue blessée, appelez le CROSS (196 au portable) qui relaie au Réseau tortues marines de Méditerranée.

Le cachalot (Physeter macrocephalus) et le rorqual commun (Balaenoptera physalus). Les deux géants du Sanctuaire Pelagos. Les rorquals, deuxièmes plus gros cétacés au monde, remontent en Ligure nord chaque été pour se nourrir de krill. Les cachalots fréquentent le canyon sous-marin au large de Bastia, Calvi et Hyères. Approche réglementée : 100 m d'interdiction absolue depuis l'arrêté préfectoral du 30 décembre 2020. Pas de poursuite, pas de coupure de route.

Le grand dauphin (Tursiops truncatus). Le plus commun des cétacés côtiers. Population française estimée entre 1 200 et 1 500 individus (Sanctuaire Pelagos, 2023). Même règle des 100 m, nage avec animaux interdite depuis 2021. J'ai vu des zodiacs faire tourner une famille de dauphins pendant 20 minutes au large de Giens en juillet 2024. Ils étaient dans leur droit de s'énerver, nous dans le nôtre de dénoncer.

Posidonies et mouillage : la règle que tout plaisancier doit avoir intégrée en 2026

Depuis l'arrêté préfectoral n°123/2019 du 3 juin 2019 du préfet maritime de Méditerranée, le mouillage est interdit sur les herbiers de posidonie dans les eaux intérieures et territoriales françaises. Une série d'arrêtés départementaux (Alpes-Maritimes, Var, Corse-du-Sud, Haute-Corse, Bouches-du-Rhône) a ensuite décliné la règle pour les navires de 20 ou 24 mètres et plus. Depuis la refonte de 2022-2023, la règle s'applique dans les faits à tous les navires, pros comme plaisanciers.

Ce que cela veut dire concrètement.

Avant de mouiller, regardez le fond. Sur les applis de navigation, les zones de posidonies sont cartographiées (Donia, Navily avec signalement communautaire, carte Medtrix de l'Agence de l'eau). Sur l'eau, la posidonie apparaît sombre, presque noire depuis la surface par mer calme. Le sable est clair, la roche moyenne. Mouillez sur sable clair, idéalement dans les "clairières" entre deux plaques d'herbier.

Les sanctions sont réelles. L'amende administrative pour mouillage sur posidonie va de 150 euros (contravention de 4e classe) à 1 500 euros selon la gravité et la répétition. Pour les bateaux de grande taille, le préjudice écologique passe devant le tribunal maritime et les condamnations montent vite. Deux exemples notoires rapportés par la Préfecture maritime : en 2022, le capitaine du yacht "Take Off" a été condamné à 20 000 euros d'amende et un an d'interdiction de naviguer en eaux françaises. La même année, le capitaine du yacht "My Falcon" écopait de 15 000 euros.

La restitution du préjudice écologique. Depuis la reconnaissance du préjudice par le Tribunal maritime de Marseille, les tribunaux imposent au contrevenant de financer la restauration de l'herbier détruit, entre 1 500 et 3 000 euros par mètre carré de matte dégradée. Un ancrage qui laboure 50 m2 d'herbier coûte plus cher qu'une saison entière en port.

Pour la technique d'ancrage propre, voir ma fiche sur l'ancrage en fond posé : approche face au vent, tenue à plat, reculade moteur, tout se joue dans les quinze premières secondes.

Les parcs marins méditerranéens : carte et règles particulières

Cinq aires protégées structurent la façade. Connaître leurs limites change les arbitrages de route.

Parc national de Port-Cros. Décret n°63-1235 du 14 décembre 1963. Le plus ancien parc marin d'Europe, cœur de 1 700 hectares terrestres et 2 900 hectares marins autour des îles de Port-Cros et de Porquerolles. Mouillage strictement encadré, zones de non-prélèvement, pêche de loisir réglementée, plongée autorisée uniquement sur des spots déclarés. En 2025, 19 mouillages organisés sur bouées remplacent le mouillage libre dans le cœur marin.

Parc national des Calanques. Créé en 2012, entre Marseille et La Ciotat. 43 500 hectares marins. Zones de non-prélèvement renforcées autour de Riou, du cap Croisette et de Sormiou. Pêche de loisir autorisée mais avec liste d'espèces protégées spécifiques au parc. Mouillage gratuit sur bouées écologiques dans la plupart des calanques (En Vau, Port Miou, Sormiou en basse saison).

Parc naturel marin de la Côte Bleue. Plus ancien parc marin français (1983). 9 874 hectares entre Marseille et Martigues. Deux réserves intégrales (Cap Couronne, Carry-le-Rouet) où tout prélèvement est interdit depuis plus de quarante ans. Biomasse de poisson multipliée par 4 à 7 à l'intérieur d'après les suivis du parc.

Parc naturel marin du Cap Corse et de l'Agriate. Créé en 2016, 6 830 km2, le plus grand parc marin métropolitain.

Sanctuaire Pelagos. Signé à Rome le 25 novembre 1999 par la France, l'Italie et Monaco, entré en vigueur le 21 février 2002. 87 500 km2 dans le bassin corso-liguro-provençal. Classé Aire Spécialement Protégée d'Importance Méditerranéenne en 2001. Pas une zone interdite, une zone où les règles anti-collision et anti-approche des cétacés sont durcies. Les traversées Nice-Calvi et Toulon-Ajaccio la traversent en entier.

Règles saisonnières et zones d'interdiction tournante

Plusieurs interdictions sont saisonnières et mobiles. Trois à retenir pour 2026.

Zones de mouillage organisées (ZMO) en haute saison. Le Var et les Alpes-Maritimes généralisent les ZMO de mai à octobre. Réservation à l'avance via Donia Waves ou la plateforme Nautigo. Hors ZMO, le mouillage libre reste possible sur sable, interdit sur posidonies. Tarif indicatif 2026 : 30 à 70 euros la nuit selon le site et la taille du bateau.

Fermeture estivale des zones de reproduction. Certaines calanques et baies corses (Rondinara, Santa-Giulia, baie d'Alga) ferment totalement le mouillage de mi-juin à mi-septembre pour préserver les zones de reproduction des sars, des mulets et des tortues. Vérifier avant de partir sur le site de chaque parc.

Pêche au thon rouge. Ouverture très courte, souvent 10 à 15 jours en juillet, avec autorisation nominative et bague (à demander à la DIRM). Hors fenêtre, capture interdite et relâcher obligatoire. Taille mini 115 cm ou 30 kg (longueur fourche).

Espèces invasives : ce qu'il faut signaler

Le plaisancier a un rôle actif dans le suivi des espèces invasives. Deux signalements remontent souvent depuis 2023.

Le crabe bleu américain (Callinectes sapidus). Installé dans les lagunes depuis 2019, en progression rapide vers l'ouest (Camargue, Sète, étang de Thau). Il mange tout : anguilles, moules, alevins. Si vous en attrapez un, ne le rejetez pas vivant : en lagune, conservation autorisée sans quota (vérifier selon département). Signalement via Info Espèces ou l'appli INPN.

La caulerpe (Caulerpa cylindracea et Caulerpa taxifolia). Algue verte envahissante qui colonise les fonds entre 0 et 40 m. En sortant d'un mouillage infesté (Monaco, Saint-Tropez, Fréjus), rincer ancre et chaîne à l'eau claire avant de relarguer. Un fragment de 1 cm peut recoloniser une zone entière.

Le poisson-lion (Pterois miles). Remonté depuis Suez, observations sporadiques côté français depuis 2022. Piqûres très douloureuses. Toute observation à remonter à l'OFB.

Pour la philosophie générale du respect des animaux croisés, je renvoie au futur guide des interactions faune et plaisance, et pour le volet atlantique, voir la biodiversité atlantique côté plaisance qui traite des phoques, des oiseaux de mer et des dauphins communs de Gascogne.

Sanctions : barème synthétique à imprimer

Résumé des ordres de grandeur en 2026. Les montants exacts varient selon la qualification retenue par le procureur.

À retenir pour un usage courant : sur la Côte d'Azur, les contrôles par drone et vedette des affaires maritimes se sont multipliés depuis l'été 2023. Les coordonnées des navires en mouillage sont enregistrées via AIS ; le croisement avec la carte des herbiers se fait en automatique. Ne pariez pas sur la chance.

Sources

• Préfecture maritime de la Méditerranée, arrêté n°123/2019 du 3 juin 2019 et déclinaisons départementales (premar-mediterranee.gouv.fr)
• Préfecture maritime de la Méditerranée, arrêté du 30 décembre 2020 sur l'approche des cétacés
• DIRM Méditerranée et préfecture de Corse, arrêtés du 20 décembre 2023 reconduisant les moratoires mérou brun et corb jusqu'en 2033
• Office français de la biodiversité, fiche "Herbiers de posidonies", données 2024 (ofb.gouv.fr)
• Parc national de Port-Cros et Porquerolles, décret n°63-1235 du 14 décembre 1963 (portcros-parcnational.fr)
• Sanctuaire Pelagos, Accord tripartite du 25 novembre 1999 entré en vigueur le 21 février 2002 (pelagos-sanctuary.org)
• Parc marin de la Côte Bleue, suivi mérou et corb, données 2024 (parcmarincotebleue.fr)
• WWF France, dossier "Posidonie, perle de la Méditerranée", 2023 (wwf.fr)
• GIS Posidonie, observation et suivis des herbiers, programme Medtrix (gisposidonie.osupytheas.fr)

Document consulté et recoupé le 19 avril 2026. Les chiffres et textes évoluent chaque année : vérifier avant la saison.